本尊は虚空蔵菩薩（ākāśagarbha）。名のとおり「虚空を蔵する」、限りない智慧と福徳を象徴する仏で、空海が修した求聞持法（記憶と智慧を得る行）の本尊として知られ、数え十三の子に智慧を授かる「十三詣り」の対象ともなった（source=伝承）。境内の隅には淡島社が石造の小社として据えられ、これは紀州加太の淡島信仰の流れを汲み、少彦名命を祀って女性の病・裁縫・人形供養に霊験ありとされる（source=伝承）。並ぶ石仏群・庚申塔・供養塔が、この一画にかつて寺として祀られてきたことの証しである。ここには二つの様相が重なる。一つは、仏堂でありながら淡島社という神を境内の隅に抱く神仏習合の名残である。少彦名は記紀では海の彼方から来て国造りを助け、やがて常世へ去った小さき神で、隅の末社にこそふさわしい、来ては去る客神の性格を帯びる（source=伝承）。もう一つは説明板の不在そのものである。由緒を語る板がなく、石碑の銘は風化して読めない。誰がいつ自在院を建て、いつ畳んだのか——文字が失われた今、堂の佇まいと石仏の列だけが、語られない歴史の器として残る。ここでは「読めない」と正直に置くほかない。